İyilik ve Kötülük Okulu, yakın arkadaşlar Sophie ve Agatha’nın, kendilerini bir peri masalının içinde, kahramanlar ve kötü karakterlerin eğitildiği sihirli bir okulda bulmalarıyla başlar. Ancak okulda, ikili arasında büyük bir ayrım ortaya çıkar. Sophie, kahramanlar arasında yer aldığı için mutluyken, Agatha kötü karakterler grubuna dahil olur. Bu durum, arkadaşlıklarını sorgulamalarına yol açar. Her biri kendi kimliğini ve geleceğini yeniden değerlendirmeye başlar. Film, masalların ötesine geçerek arkadaşlık, sadakat ve kişisel seçimler üzerine derin bir yolculuğa çıkar. Sihirli Okul, gerçek dostluğun ne kadar test edilebileceğini ve insanların kendi hayatlarını nasıl şekillendirebileceğini keşfederken, izleyicilere önemli bir mesaj verir: Kaderimizi sadece biz yazarız.
